1925 yılında Uşak Eşme'de doğan Güner, ilk ve ortaokulu Akhisar'da, liseyi Edirne ve Yozgat'ta okudu. Yüksek öğrenimini İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi ve Yüksek Öğretmen Okulu'nda (1943 – 50) tamamladı. 1950 – 57 arasında Kastamonu Lisesi'nde fizik öğretmenliği yaptı.
Ekim 1957'de Ankara Üniversitesi, FF'ne Tecrübî Fizik asistanı olarak katıldı ve 1961 yılında polar diektrikler konusunda (Girişim metodu ile 3,2 cm dalga boyunda dipollü sıvıların kompleks dielektrik sabitlerinin sıcaklıkla değişiminin incelenmesi) doktorasını tamamladı. 1966’da Elektron Paramanyetik Rezonans Spektrometresi üzerine hazırladığı tezle üniversite doçenti ünvanını aldı.
11.1961 – 11.1962 tarihleri arasında İngiltere'de Harwell Nükleer Fizik Araştırma Laboratuarı'nda yavaş nötron saçılmaları üzerinde çalışmalarda bulundu. 11.1966 – 6.1968 tarihleri arasında AÜ, FF ve Tıp Fakültesi ile Zafer Mühendislik Yüksek Okulu'nda dersler verdi.
Haziran 1968'de AÜ, Tıp Fakültesi'ne tam kadro ile geçti ve Medikal Fizik kürsü başkanı olarak görevlendirildi. 1969 – 73 yıllarında Diyarbakır Dicle Üniversitesi, Tıp Fakültesi'nde ek görevlendirme ile fizik ve biyofizik laboratuarlarının kurulmasına katkıda bulundu; orada dersler verdi. Haziran 1975 tarihinde AÜ, Tıp Fakültesi'nde profesör ünvanı aldı ve Medikal Fizik Kürsü Başkanı olarak görevine devam etti. 1983 yılında emekliye ayrıldı. 22 Eylül 1994’te vefat etti.
Profesör Ziya Güner’in, çoğunluğu AÜ, FF ve Tıp Fakültesi dergilerinde olmak üzere, yirminin üzerinde bilimsel makalesi ve Tıp ve Biyoloji öğrencileri için Fizik I, II ve III adlı üç kitabı vardır. (Prof. Dr. Zekeriya Aydın)